考量飛機上感染武漢肺炎風險高，中央流行疫情指揮中心今天宣布，考量中國武漢肺炎疫情嚴峻，10日起兩岸客運航線除往返北京、浦東、虹橋、廈門及成都航線外，其餘大陸城市往返台灣客運航班暫停飛航至4月29日；且只要過境中港澳者得入境者，也需居家檢疫14天。 （相關報導： 武漢肺炎風暴》哈佛華裔學者丁亮：疫情「史上最毒」，至少一個月後才會到達頂峰！ ｜ 更多文章 ）
交通部也依據衞生福利部防疫要求，自台北時間2月10日至109年4月29日，兩岸客運航線除往返北京首都機場、上海浦東及虹橋機場、廈門高崎機場及成都雙流機場之航線外，其餘大陸城市往返台灣客運航班暫停飛航。
