綠營共諜案引發關注，先是立法院前院長游錫堃辦公室助理盛礎纓遭中共滲透，再到民進黨民主學院前副主任邱世元、總統府總統辦公室諮議吳尚雨、國安會秘書長吳釗燮前幕僚何仁傑等人都遭到檢方查辦。對此，行政院長卓榮泰今（17）日在行政院會中裁示，現今查核制度需要再次重新檢視，政府必須從制度面加強把關，提供公務人員更有力的保障，他也請馬永成政委兩週內邀集相關單位研議強化方案，請所有公務人員必須加強國安意識，堅守對國家的忠誠。
政院發言人李慧芝會後轉述，卓榮泰院長就國家安全及公務人員任用法制表示，面對日益嚴重的境外敵對勢力滲透，在政府積極偵辦下破獲數起共諜案件，其中被滲透的機關多屬於機敏單位，凡涉案人員一率依法嚴懲，而政府應全面加強國家安全的機制。
卓榮泰指出，根據《公務人員任用法》第四條，涉及國家安全及國家重大利益的公務人員，需要辦理特殊查核，然而現今查核制度需要再次重新檢視，政府必須從制度面加強把關，提供公務人員更有力的保障，他也請馬永成政委兩週內邀集相關單位研議強化方案，請所有公務人員必須加強國安意識，堅守對國家的忠誠。
媒體問到是否會修改相關法條，政務委員林明昕說，關於《公務人員任用法》品德與忠誠的考核，第4條有授權法規命令做比較具體、細節的規範，因此它是有法律與命令的層次，他強調不是所有人員任用後都要做這工作，須有特殊的情形才會有，這不是一個大的制度改革，而是在舊有制度下落實。 （相關報導： 賈永婕看到2字氣炸！她台中同框藍委、盧秀燕被酸「不用大腦」：不只侮辱了我 ｜ 更多文章 ）
李慧芝補充，目前的查核是以職等、職稱辦理，不是以接觸機密的方式辦理，這可能會是未來檢討的方向。至於跟隨國安會秘書長吳釗燮多年的何仁傑涉共諜一案，行政院人事長蘇俊榮說，任用的時候都有接受特殊查核過，但這也是為何要檢視的、如何去落實，像是進來之後，是不是要每年都要審查？這是未來要精進的地方。
