美國總統川普（Donald Trump）宣布實施對等關稅，並表示很快就會就晶片和藥品課稅，令外界擔心未來國內會出現缺藥潮。有專家認為，台灣對於進口藥品為零關稅，預估不會出現大規模的缺藥潮；但也有專家分析，美國此舉勢必會讓藥品製造的成本上漲，進而提高售價，呼籲健保署應有所因應，否則一旦健保給付價格低於藥品成本價，藥品就有退出台灣市場的風險。
台灣藥學會及台灣醫藥品法規學會理事長康照洲指出，美國進口台灣的大多是比較昂貴的新藥，如癌症用藥等，而台灣進口藥品本來就是零關稅，預計不會受影響。但可以預期的是，美國對各國加徵關稅後，物價勢必上漲，未來美國藥品也會因為成品提高而漲價。
新光醫院副院長、台灣醫務管理學會理事長洪子仁分析，目前台灣進口自美國的藥品關稅為零，但美國原料藥最大供應國9成來自中國大陸，原料藥若面臨高關稅壓力，美國藥廠生產藥品成本勢必上升，連帶導致全球藥品價格上漲，一旦台灣健保給付趕不上藥價上揚成本，藥品就會退出台灣市場，造成缺藥的風險。
康照洲認為，實情就是目前根本無法評估是否會有缺藥的問題，「川普的對等關稅政策搞得世界大亂，誰也說不準」。他呼籲食藥署和健保署盡快盤點列出只有美國有的藥品清單，哪些是非得從美國製造進口，哪些又是歐洲、跨國藥廠也有類似的藥品。
美國是台灣西藥製劑最大出口國，根據「2024生技產業白皮書」，2023年台灣藥品出口美國淨值高達新台幣185.39億元，在這波關稅戰中也可能受到衝擊。康照洲說，因為台灣進口藥品是零關稅，談判空間較大；國內藥廠包括保瑞、永信、東洋都有外銷，其中保瑞在美國還有設廠。像如此在美國當地直接設廠的藥廠，就不會受到此波川普關稅之亂的影響。
台灣藥物基因體學會理事長張偉嶠表示，台灣在學名藥、非新成分新藥領域具有一定實力，生產製造相對穩定，其風險主要來自於原料藥的來源與價格，但原料藥並不來自美國，各國供應鏈高度仰賴中國與印度。
張偉嶠補充，當全球供應鏈出現壓力，若川普對於中國及印度藥品原料藥實施加徵關稅政策，推升美商取得原料藥的價格，隨之影響美國製藥業的藥品生產成本，新藥的價格自然就會提供高；除非健保願意以更高的價格來購買，否則，台灣便可能面臨新藥供應中斷或新藥短缺的風險。 （相關報導： 台積電恐被罰10億美元？護國神山剛入列「注意股」 川普又威脅不做一事就課100%稅 ｜ 更多文章 ）
健保署回應，若因全球供應鏈生態改變，導致生產成本遽增，廠商可以「全民健康保險藥物給付項目及支付標準」第34條、第35條規定，向健保署提出價格調整建議。
