「我們很清楚這個案子的效應很大,牽涉到的人都是重要政治人物,一定要非常謹慎,我們沒有加工添料,用最嚴格的證據決定起訴馬英九,對於外界的誤解,我們也有心理準備。」一名三中案專案小組成員語重心長地說。巧合的是,七月十三日馬英九即將迎接六十八歲生日,就在他生日前夕,台北地檢署對他送出高達七六二頁、超過五十一萬字的起訴書。檢方認定,馬主導賤賣三中及舊黨部大樓交易案,造成國民黨將近七十三億元的損失,不但將他依《證券交易法》的特別背信、非常規交易罪起訴,還建議法院「從重量刑」。如果罪名成立,馬將面臨面臨三年以上、十年以下徒刑。