立法院上會期結束不久,柯文哲2024年總統選舉政治獻金申報就被監察院查到申報不實短報二千多萬,另爆出所設木可公司所報單據有諸多不合情理,民眾黨雖召開記者會並將責任推由所委託之會計師及財務長,但問題越爆越多,後來亦傳出其使用選舉補助款四千多萬購買商辦做為個人辦公室及其太太亦頻頻傳出前往洽購上億豪宅,柯文哲被迫召開記者會,表示選舉補助款2/3供己使用,但以買商辦做為個人辦公室他覺得不恰當並為此道歉。惟這樣的說法並不能制止大眾對其人誠實、清廉人設的質疑,而後檢調單位並搜查中央黨部及木可公司。案件並延燒到京華城容積率放寬至840%不符法規之弊案,住處並遭檢調蒐查柯並收押禁見,並差點羈押禁見,整個案件仍在進行中。