被質疑設立後恐淪為總統蔡英文「政治遺產」，擱置2個月的台大國際政經學院設立案，近日將在校務會議再次闖關。台大校長陳文章根據《國家重點領域產學合作及人才培育創新條例》提出設立國際政經學院，但10月21日首次在校務會議表決時，因59票贊成擱置、51票反對擱置，等於爭議太大，於是決議將該案擱置，此案將在12月23日校務會議再審。
台大此案爭議主要有二，第一是因為依據《創新條例》設立的學院，是由國發會出資一半，審議會也必須納入政府代表，校內擔憂政治力介入，更可能形同即將卸任蔡英文的「政治遺產」；第二是其課程性質與社會科學院相近，台大政治系、財經系等系均曾提出意見，擔憂既有系所「被吃掉」。
