今年七月華航總統專機爆出私菸案，華航從今（14）日開始，全航線暫停販售免稅菸品，旅客搭乘華航時，將無法在飛機上買到免稅菸，為期半年。華航表示，由於接獲財政部關務署台北關通知，因應今日起存倉菸品出口通關作業方式調整，因此全航線航班暫停銷售免稅菸品。
立法委員黃國昌今年揭發專機私菸案，此案導致多名高層人員遭撤職、起訴，其中包含華航前副總邱彰信、總統府侍衛室少校吳宗憲、張恒嘉等13人。
機上免稅品原暫時存放保稅倉庫，依據《保稅倉庫設立及管理辦法》第32條規範，經海關核准專供航行國際航線飛機用品的保稅倉庫，其存倉物品為應其所屬航行國際航線飛機之頻繁提用，得先行申辦退運出口手續，在未裝機退運出口前應依海關規定置於放行貨物倉間，仍受海關監管。但華航日前接獲台北關通知，要求免稅菸品不能放置於保稅倉庫，因此華航只好暫停銷售免稅菸半年。 （相關報導： 華航總能「化險為夷」？台北關違反財政部函釋，華儲運毒案2億罰鍰最後只剩6萬 ｜ 更多文章 ）
華航表示，目前僅暫停銷售免稅菸，其他免稅商品則不受影響。
