今年度中央政府總預算案引發朝野激烈衝突，立法院年初統刪外交部一般事務費10%，近來外交部長林佳龍及外交部領務局代理局長陳尚友，於外交國委員會備詢及說明後，引發在野猛烈批評，護照安全存量問題引發風波；對於外界「護照規費1300元，為何沒錢印」的質疑，領務局25日強調每本成本高達1647元，印製後每本都虧損約350元。對此，「台灣事實查核中心」針對護照傳出10月後用罄、無法印製等討論，發布查核報告。
林佳龍4月21日在立法院表示，因預算遭刪減或凍結，外交部評估護照可能於10月無法印製，而後掀起媒體廣泛報導及社群討論潮。事實查核中心在調查報告中還原詢答過程，當時民進黨立委陳俊宇問及，預算只能支應185萬本空白護照，若申辦踴躍，今年10月底護照安全存量就會吃緊，護照印發作業是否受影響、如何因應？林佳龍回應，因為預算刪凍，內部估計護照到10月可能就沒辦法印製。
而後陳尚友接著說明，今年評估核發209萬本，依此速度大概短缺15至20萬本，雖有安全存量，但會造成「卯吃寅糧」的現象恐提前用罄，領務局會聯繫中央印製廠，提早展開製作招標工作；至於立委追問安全存量是否能因應10月後不足的狀況，陳尚友表示，安全存量預估2個月，1個月20到25萬本，總計存量約40、50萬本，若10月底用完，12月可能1本都不剩，所以要提早準備。
查核報告中指出，審查後領務局攸關「護照印製」的一般事務費統刪10％，印刷費用將剩約8.8億萬元，據外交部計算，可採購約185萬本空白護照、短缺24萬本空白護照。就外交部新聞稿及過去經驗來看，護照印製預算若不敷使用，若有需要可經行政院同意，動用第二預備金支應。此外，領務局也說明，護照決標數量不等於全年需求量，2024年決標180萬本護照僅是單次需求量，後續會因應民眾需求、動態追加。
另外，除10月後有無護照可辦的查核外，針對「護照規費每本1300元，外交部卻喊沒錢印」的質疑聲浪，事實查核中心在另一篇查核報告中指出，民眾申辦護照時繳納的每本1300元規費，依《公庫法》規定，須全數繳入國庫作為中央政府歲入，預算專家指出，《預算法》規定「收歸收、支歸支」，繳庫後不能隨便花用，各部會若預算不足，也不能直接動用規費收入，應依法申請預備金。領務局也表示，外交部無法擅自使用護照規費收入。
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