被迫轉進山區的車臣獨立運動份子並沒有就此停止對俄羅斯政府的挑戰,陸續發動了一連串死傷無數的恐怖攻擊,包括2002年10月莫斯科杜布羅夫卡(Dubrovka)劇院人質挾持事件,造成130名人質不幸喪生;2004年5月,一場紀念擊敗納粹的活動中發生了爆炸案,造成包括總統卡迪洛夫在內共6人喪生;同年8月24日,兩架裝有爆炸裝置的俄羅斯民航機相繼墜機,90人身亡;8月31日,一枚裝滿金屬釘的炸彈在莫斯科地鐵站外爆炸,造成至少8人被炸死;9月1日,馬沙卡多夫與巴沙耶夫在北奧塞夏(NorthOssetia)共和國巴斯蘭(Beslan)市的第一學校挾持了近200名兒童及40名的家長與教師,要求宣佈車臣共和國獨立的事件更引起了國際關注。