海基會副董事長兼秘書長高孔廉將在春節後正式去職，高層猶在思考適當接替人選，卻已傳出海基、陸委兩會人馬角力。被視為高孔廉去職導火線的海基會顧問朱甌，一再被陸委會方面點名接任秘書長；海基會內部卻也傳出在敲定秘書長人選前，不排除由身兼陸委會副主委及海基會副董事長的張顯耀「督導」秘書長職位。相互放話較勁，火藥味十足。
在請辭獲准消息曝光後，高孔廉曾意有所指地表示「談判團隊應分享資訊」，外界解讀為被解讀為海、陸兩會不和傳聞檯面化。高層對接替人選的徵詢進度保密到家，也導致海、陸兩會內傳聞不斷，相互點名對方人馬可能出線。
海基會方面消息透露，近來陸委會另闢與中國國台辦直接溝通的管道，年後登場的王張會以及外界期待的馬習會，都是重大任務；除了主角之一陸委會主委王郁琦外，幕後負責實際規劃的則是陸委會副主委張顯耀；由於目前張顯耀兼任海基會副董事長，因此在秘書長人選敲定前，可以督導方式兼掌秘書長職務，彌合過去一年多海、陸兩會的溝通不良。
對此說法，張顯耀表示「從未聽說」，目前會全心做好既定的工作。而陸委會人士則分析，張顯耀已經以副董事長身分參與海基會運作，加上兩岸交流未來重頭戲將移轉至陸委會，張顯耀不太可能轉進海基會。
對於海基會點名張顯耀，陸委會則傳出一直未現身幕前的朱甌可能性更高。陸委會人士分析，高孔廉留下的是副董事長與秘書長兩個職缺，若一直找不到既符合副董事長輩份、又足以負責秘書長實權的人選，分開處理反而彈性更大，「與董事長林中森合作良好的朱甌可以先接任秘書長」，未來再視情況調整。
據指出，曾在大陸進修，又曾長期在國民黨內工作的朱甌，在海基會一直陪同林中森處理大陸訪賓及台商的接觸與應酬，對台商網絡有所掌握。無論是否接掌秘書長職位，未來掌握台商動態的工作將移到朱甌身上。
對於種種人事傳聞，府方高層表示，仍在個別徵詢中，但副董事長與秘書長人選均要董事會通過，才會正式定案。
