馬英九基金會去（2024）年邀陸生團來台參訪，團中成員、復旦大學學生宋思瑤一席「祖國論」掀起波瀾，台大學生更舉牌表達抗議，前總統馬英九10日前往內政部移民署說明。對此，前立委邱毅直指，總統賴清德當局約談馬英九，就是俗稱的查水表，意在製造寒蟬效應，這就是具體的綠色恐怖呈現。
內政部表示，函請馬英九基金會陳述意見，依「行政程序法」相關規定辦理；馬英九在進入移民署說明前，受訪時呼籲賴政府，勿以政治力量和行政手段，阻斷兩岸青年交流的珍貴機會，這對兩岸和平穩定不利，也不符合台灣民眾利益。邱毅對此在臉書直指，移民署是行政院三級單位，賴政府此舉是在羞辱馬英九，製造寒蟬效應，破壞兩岸交流，遂行綠色恐怖。
邱毅認為，馬英九邀請包含桌球好手馬龍在內的大陸高校師生來台交流，一開始交流氣氛很好，但大概是見不得兩岸關係緩和，賴政府開始興風作浪，職業學生鬧場，媒體網軍加入戰團，正面報導變成負面抹黑攻擊。去年12月1日宋思瑤受訪時對「中國台北隊」拿世界棒球賽冠軍表達祝賀，並說願與台灣同胞一起為祖國奮鬥，這句話聽在台獨耳裡，就是不舒服。
邱毅續指，於是借題發揮，把珍貴的兩岸年輕人交流給破壞了。賴政府的壞居心，就是要破壞兩岸交流，好讓抗中保台繼續騙、繼續魔音入腦，製造台灣社會的扭曲。且陸生團離開後，賴政府繼續緊追不放，陸委會要懲罰馬英九基金會，2年來不得辦類似交流活動，現在還用移民署來約談馬英九，目的在製造寒蟬效應，這就是具體的綠色恐怖呈現。
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